Cơ sở chính của IVAC đóng tại Nha Trang, lấy bộ phận sản xuất vacxin và huyết thanh của Viện Pasteur Nha Trang làm nền tảng. Bộ phận này đã được bác sỹ Alexandre Yersin thành lập năm 1895. Trong một thời gian dài, đây là cơ sở sản xuất vacxin và huyết thanh quan trọng nhất ở Việt
Nam. Tổng diện tích mặt bằng của cơ sở Nha Trang là 13.946m2.
Cơ sở chính tại Nha Trang được phân thành 03 khối, mỗi khối do một Phó Viện trưởng phụ trách:
Khối Kinh tế:
- Tổ chức hành chính
- Kế hoạch – Tài chính
- Vật tư
- Tiếp thị
Khu hành chánh, được xây dựng dưới thời bác sỹ A. Yersin (1895)
Khối Sản xuất:
- Vacxin BCG
- Vacxin DPT
- Huyết thanh
- Môi trường
- Thành phẩm
Khối Quản lý chất lượng:
- Quản lý hồ sơ QA
- Kiểm định (QC) – Chăn nuôi súc vật thí nghiệm
Ngoài ra, Viện trưởng còn trực tiếp phụ trách hai bộ phận:
- Nghiên cứu, phát triển
- Hợp tác quốc tế
Tại cơ sở Nha Trang, những hoạt động nghiên cứu, sản xuất chính của Viện đã diễn ra và mãi là những điểm son, góp phần tạo nên thành tích chung của Viện:
- Từ năm 1978 đến nay, nơi đây đã sản xuất vacxin dại Fuenzalida đáp ứng đủ nhu cầu trong cả nước với chất lượng ngày một nâng cao.
- Từ năm 1990 đến nay, vacxin BCG được sản xuất trên những thiết bị mới với máy đông khô và máy hàn tự động Kumabe có công suất lớn được đặt tại Nha Trang. Cở sở Nha Trang hiện đã sản xuất đủ vacxin BCG phục vụ cho Chương trình TCMR và có thể sản xuất với số lượng lớn hơn để xuất khẩu.
- Năm 1995, thực hiện dự án đầu tư nâng cấp Viện từ nguồn ngân sách Nhà nước. 9 hạng mục công trình nhà xưởng : sản xuất, chăn nuôi, kiểm định được xây mới phù hợp của cơ sở sản xuất hoàn chỉnh.
Khu sản xuất Vacxin DPT
- Năm 1996, khánh thành dây chuyền sản xuất ORS phục vụ chương trình phòng chống bệnh tiêu chảy (CDD).
- Huyết thanh là sản phẩm truyền thống của Viện có từ thời bác sĩ Yersin. Đến năm 1999, Viện hợp tác với Viện huyết học và truyền máu CLB (Hà Lan) nâng cấp trang thiết bị tinh chế huyết thanh với quy mô công nghiệp tại cơ sở Nha Trang. Ngày nay, Viện là cơ sở duy nhất tại Việt Nam sản xuất các huyết thanh kháng độc tố uốn ván (SAT), độc tố bạch hầu (SAD), huyết thanh kháng dại (SAR), huyết thanh kháng nọc rắn độc (SAV) cung cấp cho công tác điều trị và dự phòng.
Nồi lên men sản xuất vac xin Bạch hầu
- Năm 2002, nâng cấp dây chuyền và ổn định sản xuất các bán thành phẩm : bạch hầu, ho gà, uốn ván tại Nha Trang, chấm dứt tình trạng chuyển bán thành phẩm từ Đà Lạt về, tốn kém và không an toàn.
- Phát triển nhiều sản phẩm mới, đa dạng hóa sản phẩm phục vụ thị trường trong nước và một phần để xuất khẩu.
Viện Vacxin đã không ngừng nâng cao chất lượng cũng như số lượng các loại vacxin và huyết thanh. Hiện nay các cán bộ kỹ thuật của Viện, những người đã được tiếp thu chuyển giao kỹ thuật từ các tổ chức và từ các Viện quốc tế khác nhau, có khả năng sản xuất được các loại vacxin và huyết thanh với chất lượng đạt tiêu chuẩn của Tổ chức Y tế thế giới.
Ngày nay, tại cơ sở Nha Trang, Viện tập trung sản xuất các loại sản phẩm:
- Vacxin Bạch hầu – Ho gà - Uốn ván hấp phụ (DPT)
- Vacxin Bạch hầu - Uốn ván (Td)
- Vacxin Uốn ván hấp phụ (TT)
- Vacxin phòng lao (BCG) đông khô 10 liều, 20 liều
- Vacxin tả uống
- Huyết thanh kháng độc tố uốn ván tinh chế (SAT)
- Huyết thanh kháng dại tinh chế (SAR)
- Huyết thanh kháng độc tố Bạch hầu tinh chế (SAD)
- Huyết thanh kháng nọc rắn hổ đất tinh chế (SAV-Naja)
- Huyết thanh kháng nọc rắn lục tre tinh chế (SAV-Tri)
- Superferon (Interferon a - 2b)
- Ivacferon nhỏ mũi (sản phẩm ra đời nhằm phòng trị bệnh cúm và các bệnh truyền nhiễm khác)
- Im.BCG sống đông khô.
- Tuberculin P.P.D đông khô.
Quá trình phấn đấu xây dựng và trưởng thành của Viện Vacxin với nòng cốt là cơ sở Nha Trang trong hơn một phần tư thế kỷ là một quá trình biết bao thăng trầm biến cố: khó khăn của thời kỳ bao cấp, những thách thức của thời kỳ đổi mới, cơ chế thị trường đầy biến động… nhưng Viện đã đoàn kết vượt qua, vươn lên mạnh mẽ, hoàn thành xuất sắc trọng trách của ngành y tế giao phó, tiếp tục đạt thành tích cao hơn nữa trong sự nghiệp cao cả: sản xuất vacxin phục vụ công cuộc bảo vệ sức khỏe nhân dân trong thời kỳ đổi mới đất nước hiện nay.